第一章  绪论

  第一节  药物发现的历史与发展

    一、药物发现的历史进展

    二、药物研究的基本途径

    三、药物的命名

  第二节  药物设计方法

    一、合理药物设计

    二、靶点与配基

    三、先导物的发现

    四、药物作用的体内途径

    五、先导化合物优化

第二章  药物作用的生命科学基础

  第一节  疾病病因学

    一、分子调控与疾病

    二、信号分子与信号传导途径

    三、外源性分子调控

  第二节  药物作用的靶点

    一、药物作用的靶点类型

    二、生物大分子的结构、特点与功能

    三、生物膜与药物跨膜转运

  第三节  药物与体内生物靶点作用的化学本质

    一、药物与靶点之间的相互作用力

    二、药物与靶点作用的动力学模型

    三、药物与靶点之间的互补关系

第三章  先导化合物发现的基本方法

  第一节  先导化合物

    一、先导化合物的定义

    二、先导化合物的确定和标准

  第二节  先导化合物的发现

    一、现有生物活性物质的修饰

    二、系统筛选的应用

    三、生物信息的应用

    四、基于病理学、分子生物学等相关知识的设计

  第三节  高通量筛选、组合化学与化合物库

    一、高通量筛选的基本概念与应用

    二、组合化学的基本原理和方法

    三、点击化学及其应用

    四、化合物库的构建

第四章  基于靶点结构的先导化合物发现

  第一节  药物设计的信息学基础

    一、化学信息学

    二、生物信息学

    三、数据库与医药信息查询

  第二节  计算机辅助药物设计概论

    一、计算机辅助药物设计的发展

    二、计算机辅助药物设计的基本理论与方法

  第三节  基于靶点结构的药物设计

    一、基于靶点结构的药物设计的基本原理

    二、蛋白质结构模拟

    三、分子对接

    四、虚拟筛选

    五、全新药物设计

第五章  基于配体结构的先导化合物发现

  第一节  基于配体结构的药物设计的基本原理

  第二节  定量构效关系研究

    一、定量构效关系研究的基础

    二、定量构效关系模型的建立

    三、二维定量构效关系

    四、三维定量构效关系

  第三节  药效团模型法

    一、药效团模型的基础

    二、构建三维药效团模型的方法

    三、基于药效团模型的三维数据库搜索

第六章  作用于核酸的先导化合物发现

  第一节  核酸的生物学基础

    一、核酸及其结构

    二、核酸的作用基础

    三、基因技术

    四、基因技术在药物发现中的应用

  第二节  以核酸为靶点的先导化合物设计

    一、以核酸序列为靶点的先导化合物设计

    二、以核酸双螺旋结构为靶点的先导化合物设计

    三、影响核苷酸生物合成的先导化合物设计

第七章  基于提高药效的先导化合物优化

  第一节  先导化合物优化的目标

    一、先导化合物优化的准备

    二、先导化合物优化的基本原则

    三、先导化合物优化的策略

  第二节  生物电子等排体原理

    一、生物电子等排体原理基础

    二、经典电子等排体

    三、非经典的生物电子等排体

    四、“me too”药物

  第三节  拼合原理

    一、拼合原理

    二、拼合药物的类型

  第四节  骨架结构变换

    一、利用生物电子等排原理进行骨架结构变换

    二、优势结构变换

    三、骨架迁越

第八章  基于改善ADME／T特性的先导化合物优化

  第一节  药物在体内的转运

    一、药物作用的体内过程

    二、药物代谢

    三、类药性评价

  第二节  副作用选择优化法

  第三节  前药在先导化合物优化中的应用

    一、前药的基本概念

    二、前药的设计原则

    三、前药的设计方法

    四、利用前药原理优化先导化合物

  第四节  软药在先导化合物优化中的应用

    一、软药的基本概念

    二、利用软药优化先导化合物

第九章  以受体和酶为靶点的药物设计

  第一节  以受体为靶点的药物设计

    一、受体的基础知识

    二、受体激动剂

    三、受体拮抗剂

  第二节  以酶为靶点的药物设计

    一、酶的基础知识

    二、酶的激活与抑制

    三、酶抑制剂

    四、酶抑制剂的设计

第十章  肽拟似物

  第一节  肽类化合物基础知识

    一、肽类化合物的结构特征

    二、内源性生物活性肽

    三、肽拟似物

  第二节  肽拟似物设计策略与方法

    一、针对肽一级结构的设计

    二、针对肽二级结构的设计

    三、针对肽整体分子构象的设计

  第三节  非肽结构的肽拟似物

    一、从血管紧张素原到阿利吉仑

    二、从替普罗肽到卡托普利

    三、从RGD序列到拉米非班抗血栓药

    四、从白三烯D4到普仑司特等哮喘治疗药

参考文献